隨著國際貿易的不斷發展和變化，海關的商品代碼調整是一個常見現象。對于出口企業而言，這種調整可能會帶來一些挑戰，特別是當商品代碼的調整影響到已經完成的報關單時。有公司近期遭遇了這樣的情況：由于海關調整了商品代碼，導致出口貨物的報關單上的商品代碼與調整后的代碼不一致。面對這種情況，應該如何應對呢？

根據《國家稅務總局關于<出口貨物勞務增值稅和消費稅管理辦法>有關問題的公告》（國家稅務總局公告2013年第12號）第二條第三項的規定，當出口貨物報關單上的申報日期和出口日期期間海關調整商品代碼時，企業應按照報關單上列明的商品代碼申報退（免）稅。這意味著，即便商品代碼發生了變更，出口企業也應以報關單上原有的代碼為準進行申報。

此外，為了確保稅務機關能夠正確理解和處理這種情況，企業還需要提交《海關出口商品代碼、名稱、退稅率調整對應表》及相關電子數據。這樣做可以幫助稅務機關了解商品代碼調整的情況，以及調整前后的具體差異。通過這種方式，可以確保稅務申報的準確性，避免因商品代碼調整而導致的退稅問題。

所以，對于出口企業而言，面對海關商品代碼的調整，正確的做法是繼續按照原報關單上的代碼進行退（免）稅申報，并及時提交相關對應表及電子數據，以確保稅務申報的準確性和合規性。